Η Κεντρική Κλινική Αθηνών συνεργάζεται με τον ΕΟΠΥΥ καθώς και με άλλους δημόσιους ασφαλιστικούς οργανισμούς για εσωτερικούς και εξωτερικούς ασθενείς.
Στον ΕΟΠΥΥ περιλαμβάνονται τα εξής ταμεία:
- ΙΚΑ - ΕΤΑΜ
- ΟΑΕΕ
- ΟΠΑΔ / ΤΥΔΚΥ
- ΟΓΑ
- ΤΑΥΤΕΚΟ (ΚΑΠ-ΔΕΗ, ΤΑΠΑΕ-ΕΘΝΙΚΗ, ΤΑΠ-ΗΣΑΠ, ΤΑΠ-ΗΛΠΑΠ, ΤΑΠ-ΕΤΒΑ, ΤΑΠ-ΟΤΕ)
- NAT